佰莱博生物虚拟筛选实验服务
佰莱博致力于为客户提供全方位的计算机辅助药物研发服务，涵盖虚拟筛选、分子对接、动力学模拟以及合成化合物后的分子互作测试等环节。我们的专业团队拥有超过十年的经验，已为众多科研机构及企业提供优质服务。
虚拟筛选
计算机辅助药物筛选，又称虚拟筛选（Virtual Screening），是药物发现及药物筛选过程中的一种广泛应用的方法。作为基于结构的药物设计（Structure-Based Drug Design, SBDD）的一部分，当筛选数量较大时，这一方法被称为高通量虚拟筛选（High-Throughput Virtual Screening, HTVS）。虚拟筛选可根据
受体结构的有无，分为基于受体结构的虚拟筛选（Receptor-Based Virtual Screening, RBVS）与基于配体的虚拟筛选（Ligand-Based Virtual Screening, LBVS）。
基于受体结构的虚拟筛选（RBVS）采用AlphaFold/Rosetta构建高精度蛋白模型，突破晶体结构缺失限制。利用分子对接技术对化合物库中的化合物逐一进行对接，根据打分结果对化合物进行排名，筛选出与受体可能存在结合的化合物。
基于配体的虚拟筛选（LBVS）融合药效团模型的3D分子相似性匹配技术。基于2D、3D结构或者是药效团模型构建配体模型，将化合物库中的分子与配体模型比较，根据相似性对化合物进行排序，筛选出与受体可能存在结合的化合物。
在创新药物研发领域，虚拟筛选（Virtual Screening, VS）正以"计算模拟+实验验证"的双引擎模式颠覆传统药物发现流程。通过分子对接、深度学习算法与超算技术，佰莱博可帮助客户从含有数万药物分子的化合物库中精准锁定5%～30%的潜在活性分子，将实验验证成本降低80%以上，让先导化合物发现周期从数年缩短至数月。
1. 精准虚拟筛选服务
1）基于受体结构的虚拟筛选（SBVS）：采用AlphaFold/Rosetta构建高精度蛋白模型，突破晶体结构缺失限制。
2）基于配体结构的虚拟筛选（LBVS）：融合药效团模型的3D分子相似性匹配技术（基于配体或药效团筛选）。
2. 深度计算验证体系
1）分子动力学模拟：采用GROMACS进行ns级动态构象分析
2）结合自由能计算：MM/PBSA/GBSA方法精准预测结合亲和力
3）多维度对接验证：Autodock/Vina多平台交叉验证
3. 实验验证闭环服务
1）分子互作金标验证：SPR（Biacore）、MST、ITC、BLI、nanoDSF技术全覆盖
2）活性测定平台：IC50/EC50/Kd值测定一站式解决方案
三大核心优势
1）技术生态闭环：拥有"计算筛选－动力学优化－互作检测"全流程服务。
2）经验丰富：本公司拥有近8000+小分子的SPR、BLI、MST、ITC亲和力验证经验。
3）一站式服务：提供多达18种分子互作分析技术。
结果范例：Stat3蛋白天然化合物库的筛选
通过对4879种化合物的虚拟筛选，初步筛选出10种与Stat3 （human）蛋白亲和力最高的小分子，列表如下：
表1 TOP10虚拟筛选小分子
TOP10小分子与Stat3 （human）蛋白互作分析
TOP1 小分子与STat3蛋白复合物 (Cartoon)
TOP1 小分子与STat3蛋白复合物 (Surface)
TOP1小分子与Stat3蛋白互作图
TOP2小分子与Stat3蛋白互作图
TOP3小分子与Stat3蛋白互作图
TOP4小分子与Stat3蛋白互作图
TOP5小分子与Stat3蛋白互作图
TOP6小分子与Stat3蛋白互作图
TOP7小分子与Stat3蛋白互作图
TOP8小分子与Stat3蛋白互作图
TOP9小分子与Stat3蛋白互作图
TOP10小分子与Stat3蛋白互作图
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